Na Nova Iorque ameaça real em colapso sob a forma de um poderoso trituradora. Ele vai tentar tomar a cidade em questão de minutos, mas você tem que detê-lo juntamente com mutant ninja turtles. Esses caras corajosos estão prontos para qualquer dificuldade para salvar sua cidade natal da loucura. Cada um dos personagens vai ter a sua própria missão e propósito, alguém tem que preparar uma poção para destruir o mutante alguém para abater lançadores de mísseis, e alguém para derrotar o inimigo em combate próximo. Todas as tartarugas serão apenas três tentativas, se você perder, a cidade cairia.