Há um culto, onde jovens meninos aprendem a arte do ninja. Este é um caminho muito difícil, que requer não só uma boa preparação física, mas também coragem. Para cumprir com todas as leis do ninja código, nem todos podem. O jogo Ninja Boy, você será introduzido para Kuhn, um menino que decidiu dedicar sua vida ao código de ninja. Ontem, foi atacado em sua escola. Os agressores não são pessoas, e alguns monstros muito estranhas. Eles roubaram todos os tesouros da escola ninja. Agora, apenas a Kun pode recuperar roubado, mas ele precisa de sua ajuda. Você deve guiá-lo para que ele, com o número mínimo de movimentos, matar monstros e tesouros retornado.