A trégua entre os grupos durou quase um ano, até que um vírus foi encontrado em um dos computadores bandidos. Agora, temos que começar uma batalha feroz no Metal Slug 4, para não permitir que o ataque cibernético se espalhe para o servidor principal. A ameaça de destruição é forte, que pode absorver não só o sistema informático de ladrões na lei, mas tornar-se perigoso para a corporação"Anteus", que supervisiona as redes de internet do país. Trevor Spacey e Kassel Nadia já estão de pleno direito e estão preparados para se precipitar junto com você em intrusos. Não faça seu time esperar, deixe imediatamente a zona de conforto e comece a lutar contra adversários.