Nem todos os cientistas trabalham em suas invenções para o bem comum da humanidade. O herói do jogo Crazy Math Scientist não é tão altruísta quanto seus colegas. Ele quer, com a ajuda de suas armas, subjugar o mundo inteiro a si mesmo e controlá-lo a seu próprio critério. As vítimas não o incomodam. Mas, primeiro, ele terá que usar sua arma contra o exército de cozinheiros malucos, que foi atacado por seu rival, também um gênio maluco. A arma do seu herói é um blaster matemático e ele atira apenas se você responder à pergunta corretamente. Um exemplo já resolvido aparece na parte inferior, você precisa determinar se está resolvido corretamente clicando no botão correspondente em Crazy Math Scientist.