Ben 10 terá que tentar a profissão de assassino, o que é completamente incomum para ele. Seus oponentes eram criaturas alienígenas e sua destruição foi algo natural, completamente diferente de matar pessoas, e é isso que o herói terá que fazer no jogo Ben 10 Assassin. Você tem que ajudar o cara a lidar com a tarefa. Ele terá que entrar em um dos prédios onde o laboratório secreto está localizado. Uma amostra de DNA de um dos alienígenas chegou lá. É preciso roubá-lo para que as pessoas não saibam quem ele é e de onde veio. O laboratório é guardado por militantes bem treinados que precisam ser removidos. Se o herói avistar algum deles, ele atirará, então você precisa se aproximar e neutralizar o inimigo por trás em Ben 10 Assassin.