Um cara chamado Ben vai para uma área remota hoje para pegar alienígenas que estão aterrorizando os habitantes locais. Você no jogo Ben 10 Alien Catcher irá ajudá-lo com isso. À sua frente na tela, o carro do seu herói estará visível, localizado em um determinado local. Aliens aparecerão ao redor do carro em vários lugares do espaço. Eles ficarão visíveis apenas por alguns segundos. Você terá que reagir rapidamente para clicar neles com o mouse. Desta forma você vai pegar esses alienígenas. Para cada um deles, você receberá pontos no jogo Ben 10 Alien Catcher.