Os mais diferentes universos, um após o outro, são capturados pelos monstros dos banheiros Skibidi. Mario acompanha de perto as notícias e entende que mais cedo ou mais tarde eles chegarão ao Reino do Cogumelo. Ele decidiu evitar isso e foi aos mundos capturados para destruir os vilões de lá. Ele decidiu isso por um motivo, nosso herói serviu na inteligência por muito tempo, embora poucas pessoas saibam disso, e tenha todas as habilidades necessárias. O herói se encontrará no território que os monstros Skibidi capturaram. Um encanador com habilidades de espionagem deve explorar a área e tentar deixar tudo o mais silencioso possível. No entanto, o silêncio completo não pode ser alcançado. Controle seu movimento com as setas. No caminho, haverá obstáculos que você precisará pular. As colisões são inevitáveis e vale a pena prepará-las com antecedência para atacar da posição mais conveniente. O seu não poderá usar armas, pois tiros altos atrairão atenção desnecessária para sua pessoa. Envolva-se em combate corpo a corpo com o inimigo, ataque com a tecla Z e avance em Super Spy Mario VS Skibidi Toilet. Cada nível concluído será recompensado e você poderá fortalecer Mario.