Enquanto viajava pelo espaço, o astronauta Jack descobriu uma enorme base à deriva. Nosso herói decidiu penetrá-la e explorar. Mas primeiro, ele precisará encontrar uma plataforma de pouso. Você no jogo Endless Space Pilot irá ajudá-lo com isso. Você voará em sua nave espacial por uma rota específica. No seu caminho vai encontrar obstáculos e várias armadilhas. Você está habilmente manobrando em seu navio, terá que voar ao redor deles todos os lados. Lembre-se de que colisões com um obstáculo causarão danos ao navio e seu herói morrerá.