No novo jogo Ninja vs Ninja, você irá para o mundo em que vivem as pessoas da caixa. Há uma guerra entre as duas ordens do ninja e você se juntará a uma delas. Seu personagem é um homem de caixa vermelha. Ele estará na sala onde seu oponente é azul. Entre eles estarão localizados vários obstáculos e armadilhas. Você terá que guiar seu personagem por todos esses perigos e atacar seu oponente. Usando várias armas de arremesso, você destrói o inimigo e ganha pontos por isso.
