Em uma galáxia distante, uma guerra eclodiu entre as duas raças alienígenas. Você no jogo Clash Of Aliens se junta a um deles e comanda o exército. Sua frota entrará na batalha contra o esquadrão de navios inimigos. Você verá sua nave principal na sua frente na tela. Abaixo dele, estará o painel de controle. Com isso, você enviará seus pilotos para a batalha em seus navios. Eles atacando o inimigo os destruirão e por isso eles lhe darão pontos.
