Um menino chamado Jack é um valentão bem conhecido na cidade que constantemente pinta as paredes dos edifícios da cidade. Uma vez ele entrou na estação e começou a fazer outro desenho lá. Para isso ele foi pego por um policial e agora nosso cara vai precisar fugir dele. Em Rail Runner, você ajudará Jack nesta aventura. À sua frente, na tela, você verá o seu personagem, que correrá pelos trilhos da ferrovia ganhando velocidade gradativamente. Vários obstáculos surgirão em seu caminho. Quando seu herói estiver próximo a um dos obstáculos, você terá que usar certas teclas de controle. Então seu herói vai pular e voar sobre este obstáculo. Se você não tiver tempo para reagir, ele irá colidir com ela ao correr e se machucar.
