Em uma das ilhas do Oceano Pacífico, uma base secreta do governo foi localizada onde os cientistas realizaram experimentos em humanos. Mas o problema é que as cobaias se libertaram e destruíram a maior parte do pessoal da base. Alguns dos cientistas conseguiram escapar e se trancaram na cantina da base. No jogo Cry Islands você terá que penetrar na ilha e destruir todos os mutantes. Seu herói será largado de helicóptero em uma determinada parte da ilha. Com as armas prontas, você terá que avançar e olhar ao redor com cuidado. Assim que você notar o inimigo, você terá que apontar sua arma para ele e abrir fogo para matar. Atirando com precisão no inimigo, você o destruirá. Para cada morte, você receberá um certo número de pontos.