Enquanto viajava em seu iate, a princesa foi pega por uma tempestade. Houve um naufrágio e sua cabeça foi gravemente danificada. Ela foi levada para o hospital. No jogo Exotic Princess Brain Doctor você será o médico dela. Seu paciente ficará visível na tela à sua frente. Você precisará examiná-la primeiro para diagnosticar seus ferimentos. Depois disso, um painel de controle com vários instrumentos médicos e medicamentos aparecerá na sua frente. Existem dicas no jogo que irão ajudá-lo. Seguindo-os, você executará certas ações de forma consistente. Eles dirão qual ferramenta ou medicamento você precisa usar. Quando você terminar o tratamento, a princesa estará saudável novamente.
