Um exército de mortos-vivos invadiu o reino vegetal. Caminhando pela estrada em direção à capital, ela destrói tudo em seu caminho. Em Plants vs Zombies TD você comandará a defesa da capital. Uma determinada área ficará visível na tela à sua frente. Você precisará identificar locais estrategicamente importantes. Depois disso, usando um painel de controle especial, você construirá estruturas defensivas nesses locais, bem como levantará soldados das flores. Quando os zumbis se aproximam deles, suas plantas vão abrir fogo e destruir o inimigo. Para cada zumbi morto, você receberá pontos.