O governo instruiu você a estabelecer um novo laboratório secreto para o estudo de alienígenas e tudo relacionado a eles. Você no jogo SCP Laboratory Idle fará isso. Antes de você na tela, você verá a sala do laboratório. Os painéis de controle com vários ícones estarão localizados à direita. Um alienígena aparecerá no laboratório. Você terá que começar a clicar nele muito rapidamente. Cada um de seus cliques trará um certo número de pontos. Você pode usar esses pontos para comprar equipamentos científicos para o laboratório, contratar novos funcionários e adquirir vários recursos necessários para pesquisas.