Na segunda parte do jogo Vega Mix 2: Mystery Of Island, você, junto com um grupo de cientistas, continuará a explorar a misteriosa ilha que eles descobriram. Vagando pela ilha, você terá que resolver vários quebra-cabeças da categoria de três em linha. À sua frente, na tela, você verá o campo de jogo, que será dividido em células internas. Todos eles serão preenchidos com vários itens. Sua tarefa é examinar tudo cuidadosamente e encontrar objetos idênticos nas proximidades. Destes, ao mover um objeto uma célula em qualquer direção, você precisará configurar uma linha de pelo menos três objetos. Assim, você retirará esses itens do campo de jogo e por isso receberá pontos no jogo Vega Mix 2: Mystery Of Island.
