Três salsichas, incluindo uma que você controlará, competirão na corrida pela vastidão do jogo Sausage Run. Esta não é uma corrida de cross-country comum em pista plana ou uma maratona de longa distância, mas uma pista de obstáculos. Além disso, os obstáculos não são barreiras tradicionais utilizadas na corrida desportiva, mas sim vários obstáculos inusitados e bastante perigosos. Eles podem esmagar, cortar ou jogar você para fora da estrada, o que significa que você precisa ter cuidado com eles. E embora seu herói se recupere e corra novamente mesmo depois de ser atingido por um martelo gigante, isso pode retardar seu progresso e os oponentes tirarão vantagem disso em Sausage Run.
