Um mundo perigoso e aventureiro de ninjas espera por você. O herói que você controlará é apelidado de Ninja Ghost por sua capacidade de aparecer e desaparecer como um fantasma. O herói não possui habilidades sobrenaturais, mas pode se mover rapidamente, pular alto, agarrar-se às paredes e derrubar o inimigo e acertá-lo com sua espada. São essas habilidades que você usará à medida que avança pelos níveis para destruir todos os terroristas que capturaram o prédio. Os inimigos estão armados com armas pequenas que podem atingir à distância, mas enquanto a bala estiver voando, o herói poderá pular para o lado e atacar um inimigo que não esperava isso em Ninja Ghost.