Em cada nível, alguns heróis de níveis completamente diferentes aparecerão na sua frente. Podem ser garotos ou garotas comuns, super-heróis e assim por diante. No início do Persona Runner você verá um participante a partir do qual deverá criar o que lhe foi mostrado antes da corrida. O herói deve coletar algo que aumente a cor vermelha ou azul da escala. Primeiro você decide qual cor deve predominar e coleta apenas o que a faz crescer. Se o nível dele na linha de chegada for mais da metade da escala acima da cabeça do herói, você completará o nível. E o humilde corredor se transformará em um herói brilhante em Persona Runner.