Um cara com os superpoderes do Homem-Aranha foi servir na inteligência estrangeira e se tornou um agente especial como James Bond. Mas ele não precisa de uma arma; ele enfrenta seus inimigos. O que libera uma teia do arco e nela enreda o inimigo, imobilizando-o completamente. Em Mutant Assassin 3D, você ajudará o herói a completar missões eliminando agentes inimigos indesejados. O mecanismo de destruição é simples: você aponta o círculo verde para o próximo vilão vermelho e solta a teia. Ele envolve o corpo e o inimigo é derrotado. Da mesma forma, você precisa coletar pilhas de dinheiro, elas devem ser coletadas para completar o nível em Mutant Assassin 3D.
