Os corredores coloridos que você ajudará no jogo Pixel Run são compostos de pequenos pixels redondos. Eles são frágeis e podem quebrar mesmo com a menor colisão com um obstáculo. Diante disso, você deve proteger o seu homenzinho para que ele manobre com habilidade e evite todos os obstáculos. Caso isso não seja possível, escolha um obstáculo menor para que o herói perca o mínimo de seu corpo. Ao mesmo tempo, não perca as bolas que irão repor os pixels perdidos. Mesmo que o herói chegue à linha de chegada com uma perna só ou sem cabeça, o nível será contado. Você perderá se o homenzinho quase desaparecer, isso não deveria ser permitido no Pixel Run.
