Se você acompanhar as aventuras de um aluno da Escola de Mistérios chamado Phil, saberá que ele foi abduzido por uma nave alienígena. Certamente você tentou ajudá-lo. No entanto, tudo acabou não sendo tão ruim. O herói acabou sendo útil para a tripulação da nave alienígena e rapidamente se juntou à equipe. No jogo Riddle Transfer você conhecerá ele e seus novos amigos. A nave estava indo em direção à Terra, mas de repente o controle foi perdido, alguém controlou a nave de fora e a pousou à força em uma das bases secretas. Homens de preto armados levaram todos os passageiros do navio e colocaram cada um em uma sala separada. Você ajudará Phil na transferência de Riddle, e ele poderá ajudar os outros.
