Sua fazenda em Farmers Versus Aliens está sob séria ameaça do espaço sideral. Por alguma razão, alienígenas de uma galáxia distante decidiram sequestrar animais de sua fazenda, e isso não é nada bom. Nada pode explicar a perda de criaturas vivas que acreditarão que os alienígenas roubaram vacas, ovelhas, porcos e cavalos. Você terá que escondê-los e para isso deverá ajudar o fazendeiro a conduzir cada animal para uma área triangular verde na qual está desenhado o animal correspondente. Isso irá esconder todas as suas criaturas vivas dos olhos dos alienígenas. Mas apresse-se, caso contrário eles iniciarão a Operação Farmers Versus Aliens.
