Entre os ninjas, bem como entre as pessoas comuns, os bandidos e o herói do jogo Ninja Fighter vêm junto com eles e têm que lutar. Ele não está sozinho, há assistentes voluntários e eles virão. Mas a principal esperança para o herói, que você irá gerenciar. Ele é mais forte, mais esperto, e todos os outros o seguirem. Procure por inimigos e destrua-os. Eles são fortes e têm os mesmos segredos que os ninjas mais avançados. Mas sua fraqueza é que eles são maus e sem princípios, e o bem sempre supera o mal. Gerencie as setas desenhadas na parte inferior da tela se você estiver jogando em um dispositivo de tela sensível ao toque. Se houver um teclado, use as teclas ASDW.