Um pequeno alienígena verde viajando pela galáxia para descobrir novos planetas caiu na anomalia. Agora você no jogo Aliens Bubble Shooter terá que ajudá-lo a salvar sua vida e preservar a integridade do navio. Seu personagem verá uma barreira na forma de bolhas de poder multi-coloridas que se movem na direção de sua nave. Você precisará destruí-los e limpar o caminho. Para fazer isso, você usará o canhão no ar disparando projéteis especiais. Eles também terão cor. Quando um projétil atinge uma determinada cor em exatamente as mesmas bolas de cor, você vai explodi-los e você receberá pontos.