Acima de uma colônia de terráqueos, localizada em um dos planetas, estranhas bolhas multicoloridas apareceram. No final das contas, eles estão cheios de veneno. Gradualmente, eles descem na colônia de terráqueos. No jogo Bubble Planets você terá que destruí-los todos. Para isso, você usará um canhão especial. Ela vai atirar em cargas individuais também com uma determinada cor. Você terá que examinar cuidadosamente todas as bolhas e encontrar um lugar onde certos objetos estão agrupados. Eles devem ser da mesma cor de sua carga. Depois disso, você vai dar um tiro. O núcleo que atinge um grupo de objetos irá explodi-los e você receberá um certo número de pontos por isso. Sua tarefa é limpar o campo de jogo de todas as bolhas o mais rápido possível, executando essas ações.