Um homem primitivo chamado Adam caminhando pela floresta foi atacado por alienígenas. Eles conseguiram colocar nosso herói para dormir e transportá-lo para o navio. Agora Adam precisa escapar dos alienígenas para voltar para sua amada Eva. Em Adam & Eve Aliens você o ajudará nesta aventura. Ao acordar, Adam se viu na sala do navio. Ele precisará tentar sair dessa. Para fazer isso, você precisa abrir as portas. Para que as portas se abram, seu herói precisará de certos itens. Para encontrá-los, você terá que vasculhar completamente a sala e resolver certos tipos de quebra-cabeças e quebra-cabeças. Assim que você encontrar os itens e abrir a passagem, seu herói será transportado para o próximo nível do jogo.