Uma garota chamada Ellie em sua nave espacial pousou no planeta, onde descobriu uma cidade alienígena. Saindo do navio, ela foi investigá-lo. Neste momento, um cataclismo começou no planeta. O território em que nossa heroína se encontrava foi inundado. Agora no jogo Saving Elli você terá que ajudar Ellie a escapar e chegar ao seu navio. À sua frente, na tela, você verá um caminho ao longo do qual sua heroína correrá, ganhando velocidade gradativamente. No caminho vai encontrar buracos no solo, barreiras e vários tipos de armadilhas mecânicas. Você habilmente controlando seu personagem terá que superar todos eles sem perder velocidade. Se você não tiver tempo de reagir a tempo, sua garota morrerá e você perderá a rodada.