Uma guerra eclodiu entre seu país e um estado vizinho. No jogo Atari Missile Command, você comandará a defesa da base militar onde atende. À sua frente, na tela, você verá os edifícios de sua base e as armas de foguete instaladas em todos os lugares. O inimigo disparou uma massa de foguetes em sua base, que aparecerá no céu. Você terá que atirar em todos eles e evitar que caiam no território da base. Para fazer isso, usando o mouse, você definirá a mira para suas instalações com a ajuda de cruzes azuis. Abra fogo quando estiver pronto. Se a sua visão for precisa, você irá derrubar mísseis inimigos e ganhar pontos por isso. Tendo acumulado um certo número deles, você atualiza suas instalações e munição para eles.