Uma nave alienígena pousou perto da fazenda onde vive a ovelha Shawn. Sean conseguiu fazer amizade com eles e agora eles decidiram organizar uma competição de corrida conjunta. No jogo Shaun the Sheep Alien Athletics, você ajudará Shaun the Sheep a derrotá-los. À sua frente, na tela, você verá a estrada ao longo da qual Sean correrá, ganhando velocidade gradativamente. Você precisará olhar atentamente para a tela. No caminho, nosso herói estará esperando por várias alturas das barreiras. Quando o seu herói correr até este obstáculo, você terá que clicar na tela com o mouse. Então Sean vai pular e voar pelo ar sobre o obstáculo. Às vezes, na estrada, haverá vários itens úteis que seu cordeiro terá que coletar.