Após a terceira guerra mundial, muitas cidades estão em ruínas. Os sobreviventes se uniram em grupos e agora lutam por sua sobrevivência. No jogo The Last Squad, você comandará um esquadrão de soldados que saiu em busca de alimentos e remédios. Antes de você na tela você verá os soldados do seu esquadrão, que estarão localizados em um dos quarteirões da cidade. Usando um painel de controle especial, você dirigirá as ações de cada soldado. Você terá que fazê-los seguir em frente. Assim que você encontrar o inimigo, envolva-o na batalha. Usando várias armas pequenas, granadas e explosivos, você terá que destruir o inimigo e obter pontos por ele.