Na segunda parte do Funny Throat Surgery 2, você continuará a trabalhar como dentista em um hospital. Pacientes com doenças dentais virão à sua consulta. Em primeiro lugar, você precisará examinar cuidadosamente a cavidade oral e diagnosticar o paciente. Depois disso, um painel de controle aparecerá no qual vários instrumentos médicos e medicamentos estarão visíveis. Ao aplicar esses itens de forma consistente, você realizará um conjunto de ações voltadas para o tratamento do paciente. Quando terminar, ele estará completamente saudável e você começará a tratar outros pacientes.