Mario selou um projétil de um canhão e corre em direção aos inimigos, todos que desejam destruir seu Reino do Cogumelo nativo. E havia muita gente que queria capturar o mundo das plataformas do Mario, eles voavam, corriam, rastejavam e todos atiravam ou tentavam morder, como plantas carnívoras que saltam de canos. Controle o herói em Super Mario Defend para evitar lesões, mas continue disparando sem parar, caso contrário, será tarde demais. A arma do encanador é supermoderna e nem mesmo terrestre, mas de origem alienígena, foi para o herói após uma batalha com robôs. Vemos que os tempos calmos são coisa do passado, Mario terá que se tornar um verdadeiro guerreiro em Super Mario Defend.