A água ou qualquer outro líquido, seguindo as leis da gravidade, fluirá para baixo se encontrar uma saída por si mesmo, mesmo uma pequena rachadura. Em Water Flow 3D, você deve deixá-lo fluir livremente para encher os recipientes quadrados localizados na parte inferior. O número de recipientes varia, mas você deve lembrar que apenas líquido da cor correspondente pode ser derramado neles. Para fazer isso, abra as abas na ordem correta. Às vezes, os líquidos terão que ser misturados e as divisórias de vidro terão que ser quebradas com bolas pesadas no Water Flow 3D. Existem muitos níveis e são diversos em termos de definição de tarefas.