Um bravo samurai chamado Jack é membro de uma ordem secreta que protege a paz do nosso mundo de vários monstros de universos paralelos. Um dia, vários monstros foram capazes de romper os portais do tempo em nosso mundo. Agora nosso herói terá que viajar com a ajuda de um amuleto especial de acordo com esses tempos. Lá ele terá que encontrar os monstros e destruí-los. Você no jogo Samurai Jack: The Amulet Of Time ajudará o samurai nessas batalhas. À sua frente, seu personagem estará visível na tela, que estará localizado em uma determinada área. Na frente dele você verá um monstro. Usando as teclas de controle, você terá que forçar seu herói a atacar o inimigo. Ao atacar com uma espada, você destruirá o inimigo e ganhará pontos por isso.