Na direção de um pequeno assentamento localizado no Japão, um destacamento de ladrões está se movendo. Eles, no entanto, matam os moradores e saqueiam a vila. Um bravo guerreiro ninja se levantou para proteger os habitantes locais. Você no jogo Phase Ninja ajudará o herói a lutar contra os vilões. À sua frente na tela será visível a área em que seu personagem estará localizado. Uma unidade inimiga se moverá em sua direção. Com a ajuda de várias armas de arremesso e um arco com flechas, você pode destruir oponentes à distância. Quando o inimigo se aproxima, você desembainha sua espada e entra em combate corpo a corpo. Ao atacar com uma espada no inimigo, você os destruirá e ganhará pontos por isso. Após a morte dos inimigos, você poderá pegar troféus que cairão deles.