O ninja resolveu esticar as pernas e correr pela cidade coletando moedas. No jogo Ninja Runner, você conhecerá um herói e o ajudará a organizar o parkour da cidade. Não há alturas intransponíveis para o herói, você pode clicar no cara várias vezes e ele pulará para qualquer pico: uma plataforma, uma torre e outro pico. Depois de percorrer o nível, você pode passar para outro, mas tenha cuidado, em novos níveis, haverá obstáculos adicionais na forma de pontas afiadas que você não precisa pular para não perder corações da vida. Existem obstáculos cada vez mais afiados, o que significa que você terá que ser muito rápido e ágil para salvar o ninja de perder vidas em Ninja Runner.