Viajando pela Galáxia, um pesquisador chamado Tom constantemente encontra vários artefatos antigos. Para que seu herói chegue até eles, ele precisa resolver vários quebra-cabeças. Você no jogo Puzzle Galaxies irá ajudá-lo com isso. À sua frente, na tela, você verá um desenho que consiste em cubos. Cada um deles será dividido por dentro em um número igual de zonas quadradas. Em cada zona você verá uma bola de uma determinada cor. Usando as teclas de controle, você girará os cubos em torno de seu eixo no espaço. Sua tarefa é definir esses itens para que todas as bolas sejam organizadas em uma determinada sequência. Assim que fizer isso, você receberá um certo número de pontos no jogo Puzzle Galaxies e passará para o próximo nível do jogo.