Na segunda parte do jogo Ninja Hands 2, você continuará ajudando sua guerra ninja a lutar contra vários oponentes que querem matá-lo. Seu lutador ficará visível na tela à sua frente, que estará em um determinado local. O inimigo estará a uma distância dele. No canto inferior direito haverá um painel especial com ícones. Ao clicar neles, você pode forçar o herói a realizar determinadas ações. Você terá que atacar seu oponente e usar suas habilidades de luta para destruir o inimigo. Para isso, você receberá pontos no jogo Ninja Hands 2.