Os pontos vermelhos e azuis querem se encontrar, mas não têm braços ou pernas que lhes permitam se mover, mas os pontos são redondos, o que significa que podem rolar. Você precisa usar um lápis mágico e sua engenhosidade. Para fazer com que os pontos se aproximem, desenhe uma linha ou forma para as bolas rolarem e colidirem umas com as outras. Percorra os níveis, os seis primeiros já estão disponíveis e você pode escolher qualquer um, sem seguir a ordem, é preciso passar por tudo para ter acesso aos demais níveis em Brain Dots.